MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 5b str. L20 chromosome

Total Repeats: 6847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009053	ATT	2	6	1558	1563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009053	CTTT	2	8	2679	2686	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009053	AAAG	2	8	2695	2702	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009053	ATT	2	6	2715	2720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009053	TTC	2	6	2750	2755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009053	AAGC	2	8	2800	2807	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009053	GACAA	2	10	2865	2874	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_009053	A	6	6	2889	2894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009053	ATT	2	6	2947	2952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009053	AG	3	6	2988	2993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009053	T	6	6	4107	4112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009053	ATTT	2	8	4124	4131	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009053	TG	3	6	4741	4746	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009053	ATA	2	6	4774	4779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009053	TAG	2	6	4811	4816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009053	AAAT	2	8	4849	4856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009053	ATTA	2	8	6012	6019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009053	A	7	7	6046	6052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009053	TTAT	2	8	6070	6077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009053	A	6	6	6084	6089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009053	TGT	2	6	6111	6116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009053	ATA	2	6	6123	6128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009053	TCAA	2	8	7320	7327	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009053	TAA	2	6	7372	7377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009053	AAT	2	6	7391	7396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009053	AAGC	2	8	9689	9696	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009053	T	7	7	9737	9743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009053	CAAA	2	8	9758	9765	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009053	AAC	2	6	9789	9794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009053	GTG	2	6	9830	9835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009053	ATAA	2	8	10374	10381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009053	CTTT	2	8	15264	15271	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009053	AAAG	2	8	15280	15287	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009053	AAAG	2	8	15293	15300	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009053	GCAA	2	8	15369	15376	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009053	A	6	6	15387	15392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009053	GGA	2	6	15422	15427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009053	AATA	2	8	15444	15451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009053	AGAT	2	8	15458	15465	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009053	TCG	2	6	16897	16902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009053	AAT	2	6	16939	16944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009053	CAA	2	6	20622	20627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009053	A	6	6	20643	20648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009053	CTTT	2	8	20666	20673	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009053	AAC	2	6	20703	20708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009053	A	7	7	20718	20724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009053	CAA	2	6	21842	21847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009053	ACA	2	6	21874	21879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009053	A	6	6	23325	23330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009053	ATA	2	6	23394	23399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009053	A	7	7	24344	24350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009053	GTCC	2	8	24358	24365	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009053	ATTA	2	8	24418	24425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009053	TTA	2	6	24440	24445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009053	T	6	6	25121	25126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009053	ATA	2	6	25133	25138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009053	TGA	2	6	28656	28661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009053	T	7	7	28675	28681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009053	A	7	7	28733	28739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009053	TA	3	6	28749	28754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009053	T	7	7	30503	30509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009053	AAC	2	6	30514	30519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009053	A	7	7	30542	30548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009053	TTG	2	6	30556	30561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009053	A	6	6	33764	33769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009053	A	7	7	35469	35475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009053	A	7	7	35503	35509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009053	A	6	6	35544	35549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009053	AAG	2	6	37209	37214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009053	ACC	2	6	37224	37229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_009053	ATTT	2	8	37318	37325	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009053	ATA	2	6	37833	37838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009053	TCA	2	6	37847	37852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009053	AAT	2	6	38445	38450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009053	TTAGG	2	10	38462	38471	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009053	T	6	6	39154	39159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009053	ATTT	2	8	39164	39171	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009053	T	6	6	40356	40361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009053	A	7	7	40821	40827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009053	TA	3	6	40847	40852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009053	TATG	2	8	41139	41146	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009053	TCT	2	6	41639	41644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009053	T	6	6	42300	42305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009053	CTT	2	6	44187	44192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009053	A	6	6	44210	44215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009053	A	6	6	45432	45437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009053	ATC	2	6	46156	46161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009053	GAA	2	6	46172	46177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009053	TAAA	2	8	46943	46950	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009053	A	6	6	46948	46953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009053	AAT	2	6	47002	47007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009053	AT	3	6	48404	48409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009053	TGTAA	2	10	48474	48483	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009053	GTTAC	2	10	48504	48513	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_009053	TAA	2	6	51355	51360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009053	ATT	2	6	51385	51390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009053	T	7	7	52385	52391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009053	ATGCA	2	10	52441	52450	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_009053	T	6	6	52537	52542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009053	GAA	2	6	52551	52556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009053	TA	3	6	52569	52574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009053	A	6	6	52587	52592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009053	ATA	2	6	52617	52622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009053	T	6	6	52623	52628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009053	TAT	2	6	52663	52668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009053	A	6	6	52688	52693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009053	T	6	6	54675	54680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009053	ACA	2	6	54784	54789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009053	TAA	2	6	54806	54811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009053	TCT	2	6	55588	55593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009053	A	6	6	56166	56171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009053	AAC	2	6	56178	56183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009053	T	7	7	56193	56199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009053	TAG	2	6	56204	56209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009053	AATTT	2	10	57088	57097	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009053	AGGT	2	8	57222	57229	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009053	CTA	2	6	57280	57285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009053	T	7	7	57291	57297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009053	A	6	6	58603	58608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009053	AATA	2	8	58640	58647	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009053	TGA	2	6	58673	58678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009053	GT	3	6	58744	58749	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009053	TAA	2	6	58806	58811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009053	AAC	2	6	58854	58859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009053	ACA	2	6	58878	58883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009053	GTG	2	6	58907	58912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009053	GCT	2	6	60662	60667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009053	T	8	8	60686	60693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009053	T	6	6	60698	60703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009053	AAT	2	6	60763	60768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009053	GAAT	2	8	60786	60793	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009053	TTTAAT	2	12	61093	61104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009053	TTC	2	6	61844	61849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009053	A	6	6	61858	61863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009053	T	6	6	61940	61945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009053	TTAA	2	8	62020	62027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009053	AAG	2	6	62029	62034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009053	A	6	6	63805	63810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009053	T	7	7	63835	63841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009053	AGATAA	2	12	64150	64161	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009053	T	6	6	64229	64234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009053	TAA	2	6	65056	65061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009053	AGA	2	6	65077	65082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009053	TAAA	2	8	67279	67286	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009053	ATT	2	6	67817	67822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009053	GCTT	2	8	67837	67844	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_009053	TAG	2	6	67848	67853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009053	A	7	7	67857	67863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009053	AAT	2	6	67894	67899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009053	TA	4	8	68869	68876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009053	AT	3	6	68899	68904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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